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Groupes Fonctionnels (pour l'ARN)
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Functional Groups
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Position
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||
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5’
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3’
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int
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| Amino |
X
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X
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X
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| Phosphate |
X
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X
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| Phosphorothioate (PTO) |
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X
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Amino
Un groupe amino primaire peut être utilisé pour fixer une variété de modificateurs (tels que des dyes fluorescents) à un oligonucléotide ou utilisé pour fixer un oligonucléotide à une surface solide. Les modificateurs aminés peuvent être positionnés à l'extrémité 5' avec un bras spacer (C6) ou plus long (C12). Les modifications aminées peuvent être positionnées à l'extrémité 3'. Les modifications aminées internes peuvent être introduites en utilisant une base amino-dT.
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Groupes Fonctionnels
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Position
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Echelle de Synthèse [µmol]
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Purification
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|||||
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0.04
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0.2
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1.0
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15
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Des
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HPLC
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PAGE
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| Amino C6 |
5’
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X | X | X | X | X | X | X |
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3’
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X | X | X | X | X | X | X | |
Phosphate
La phosphorylation en 5' est nécessaire si un oligo est utilisé comme substrat pour l'ADN ligase. La phosphorylation 3' inhibe la dégradation par certaines 3'-exonucléases et peut être utilisée pour bloquer les polymérases de l'ADN.
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Position
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Echelle de Synthèse [µmol]
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Purification
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|||||
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0.04
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0.2
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1.0
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15
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Des
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HPLC
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PAGE
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| 5' | X |
X
|
X
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X | X |
X
|
X |
| 3' | X |
X
|
X
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O | X |
X
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X |
Phosphorothiate (PTO)
La liaison phosphorothioate (PTO) remplace un atome de soufre par un oxygène non pontant dans le squelette phosphate d'un oligo. Cette modification rend la liaison internucléotidique résistante à la dégradation par les nucléases. Des liaisons phosphorothioate peuvent être introduites entre les 3-5 derniers nucléotides à l'extrémité 5' ou 3' de l'oligo pour inhiber la dégradation par les exonucléases. L'inclusion de liaisons phosphorothioate dans l'ensemble de l'oligo contribuera également à réduire l'attaque des endonucléases.
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Position
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Echelle de Synthèse [µmol]
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Purification
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0.04
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0.2
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1.0
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15
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Des
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HPLC
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PAGE
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| Int | X |
X
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X
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X | X |
X
|
X |