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Quenchers (pour l'ADN)
Type de Modification
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Position
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Gamme de Quenching
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||
5’
|
3’
|
Int.
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(nm)
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|
X
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480-580 / 560-670 | |||
Dabcyl |
X
|
400-550 | ||
IQ-500 |
X
|
400-550 | ||
MGB-Q500 | X |
|
400-550 | |
MGB-Q530 | X |
|
450-620 |
Black Hole Quencher-1
Le BHQ-1 est mieux adapté aux fluorophores qui émettent dans la gamme de longueurs d'onde allant de FAM à TAMRA.
Position
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Echelle de Synthèse |
Purification
|
|||||
|
0.04
|
0.2
|
1.0
|
15
|
Des
|
HPLC
|
PAGE
|
5’
|
O | O |
O
|
|
|||
3’
|
|
X
|
X
|
O
|
|
X
|
X = disponible/en stock
O = sur demande
Black Hole Quencher-2
Le BHQ-2 est mieux adapté aux fluorophores dans la gamme de longueur d'onde Cy3 à Cy5.
Position
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Echelle de Synthèse |
Purification
|
|||||
|
0.04
|
0.2
|
1.0
|
15
|
Des
|
HPLC
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PAGE
|
5’
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O | O |
O
|
|
|||
3’
|
|
X
|
X
|
O
|
|
X
|
X = disponible/en stock
O = sur demande
Dabcyl
Le Dabcyl est un dark quencher relativement faible et est mieux adapté à une utilisation pour les sondes molecular beacon où épingle à cheveux plaçant le quencher et le dye à proximité immédiate.
Position
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Echelle de Synthèse |
Purification
|
|||||
|
0.04
|
0.2
|
1.0
|
15
|
Des
|
HPLC
|
PAGE
|
3’
|
|
X
|
X
|
O
|
|
X
|
X
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X = disponible/en stock
O = sur demande
Internal Quencher IQ-500
IQ-500 (quencher interne 500) est une unité de fluorescence quencher en position interne dans un oligonucléotide. Il peut ainsi être positionné à une distance FRET optimale par rapport à un fluorophore. IQ-500 est principalement utilisé comme quencher interne de sondes qPCR double quencher.
Position
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Echelle de Synthèse |
Purification
|
|||||
|
0.04
|
0.2
|
1.0
|
15
|
Des
|
HPLC
|
PAGE
|
Int |
|
X
|
X
|
O
|
|
X
|
X = disponible/en stock
O = sur demande
MGB-Q500
Le MGB-Q500 est une unité de fluorescence quencher fixée à un minor groove binding (MGB). Cette modification 3' permet de concevoir des sondes de qPCR plus courtes, mais très spécifiques. La combinaison optimale est avec FAM en 5'. Le MGB-Q500 est une alternative rentable au MGB-Q530.
Position
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Echelle de Synthèse |
Purification
|
|||||
|
0.04
|
0.2
|
1.0
|
15
|
Des
|
HPLC
|
PAGE
|
3' |
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X
|
X
|
O
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|
X |
X = disponible/en stock
O = sur demande
MGB-Q530
Le MGB-Q530 est une unité de fluorescence quencher très efficace, fixée à un minor groove binding (MGB). Cette modification 3' permet de concevoir des sondes qPCR plus courtes, mais très spécifiques, avec un niveau de bruit de fond très faible. La combinaison optimale est avec les sondes 5' FAM/HEX/JOE/Yakima Yellow.
Position
|
Echelle de Synthèse |
Purification
|
|||||
|
0.04
|
0.2
|
1.0
|
15
|
Des
|
HPLC
|
PAGE
|
3' |
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X
|
X
|
O
|
|
X |
X = disponible/en stock
O = sur demande