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ASO und siRNA Design Service
Sind Sie neu auf dem Gebiet der therapeutischen Oligonukleotide? Oder möchten Sie umfangreichere Antisense-Oligonukleotid-Screening-Experimente durchführen? Sprechen Sie mit den ASO-Experten von Microsynth und lassen Sie uns Ihre Sequenzen und Experimente entwerfen. Seit mehr als 10 Jahren unterstützen wir Forscher auf diesem Gebiet und haben dabei entscheidende Kenntnisse über das Design und die Herstellung von ASOs erworben. Microsynth bietet Ihnen eine Funktionsgarantie für die vorgeschlagenen ASO-Designs.
siRNA Design
Um Ihnen zu helfen, die am besten geeignete siRNA für Ihr gewünschtes Gen zu entwerfen, hat Microsynth eine eigene Software entwickelt und in seinem Webshop zur Verfügung gestellt. Das siRNA-Design-Tool von Microsynth verwendet eine Reihe von Richtlinien, die ursprünglich von Boese et al. bereitgestellt wurden [1]. Das Ergebnis eines Entwurfs ist eine Reihe von siRNAs, die nach Reynolds Scores [2] geordnet sind. Die siRNA-Sequenzen mit den höchsten Punktzahlen können direkt online ausgewählt und bestellt werden. Ein Link zu NCBI BLAST ist enthalten, damit Sie das Risiko möglicher Off-Target-Effekte der vorhergesagten siRNA richtig einschätzen können.
Referenzen:
[1] Boese Q, Leake D, Reynolds A, et al. Mechanistic insights aid computational short interfering RNA design. Methods Enzymol. 2005;392:73-96. doi:10.1016/S0076-6879(04)92005-8
[2] Reynolds, A., Leake, D., Boese, Q. et al. Rationales siRNA-Design für RNA-Interferenz. Nat Biotechnol 22, 326-330 (2004). https://doi.org/10.1038/nbt936
Abbildung: Microsynths siRNA-Design-Tool
Geben Sie Ihre Zielsequenz und optional einige andere Parameter wie AA vor der siRNA-Kernsequenz, Anzahl der Abschnitte mit identischen Basen, G/C-Gehalt sowie andere Sequenzeinschränkungen (z. B. Sequenzregionen, die berücksichtigt werden sollen oder nicht) an, um Ihren Designvorschlag (höchste Punktzahl oben) in einem fertigen Format zu erhalten.
ASO Design
Antisense-Oligonukleotide zielen auf spezifische genetische Elemente ab und stören den Spleißprozess der RNA. Daher ist das ASO-Design in der Regel komplexer als das siRNA-Design. Die meisten ASO-Entdeckungsprojekte beginnen mit dem Screening einiger ASO-Sequenzen, um die wichtigsten Kandidaten zu finden, die dann weiter optimiert werden können. Im Laufe der Jahre haben die ASO-Experten von Microsynth entscheidendes Know-how im Design von ASO-Sequenzen und -chemien erworben. Unser Portfolio umfasst:
- Erste Gespräche über das ASO-Entdeckungsprojekt
- Unterstützung bei der Entwicklung von ASO-Screening-Sequenzen (Microsynth verwendet modernste ASO-Designsoftware und verfügt über entscheidendes Know-how im ASO-Design)
- Unterstützung und Beratung zu Chemie, Projektdesign und Scale-up