Back to top

Entsalzt

 
Oligonukleotide werden mittels Festphasensynthese assembliert. Dabei werden die Nukleotide entsprechend der gewünschten Sequenz angehängt, was zu einem Kettenwachstum führt. Es ist allgemein bekannt, dass bei chemischen Reaktionen nie eine 100%ige Umsetzung erreicht wird. Bei der Oligonukleotidsynthese nach dem Stand der Technik werden Kopplungsausbeuten von bis zu 99,5% erreicht. Bei den nicht umgesetzten 0,5 % der Stränge kommt der Kettenaufbau zum Stillstand und es bilden sich verkürzte Sequenzen als Nebenprodukte.
Je nach Anwendungszweck ist es vorteilhaft, diese kürzeren Sequenzen aus dem Volllängenprodukt zu entfernen. Daher bietet Microsynth verschiedene Arten von Aufreinigungsmethoden an.

Übersicht

Entsalzt

Alle unsere Oligos werden zumindest entsalzt, um restliche niedermolekulare Nebenprodukte, die bei den häufigen chemischen Reaktionen während der Synthese entstehen und sich anreichern, weitgehend zu entfernen. Eine solche Reinigung ist ausreichend für Oligonukleotide, die kürzer als 30 nt sind und/oder Oligonukleotide, die für unkritische Anwendungen wie PCR, Sequenzierung, Sondierung, Mobilitätsverschiebung oder Hybridisierung verwendet werden. Für die Verwendung in molekularen Klonierungsprojekten werden entsalzte Oligos jedoch nicht empfohlen.

Mögliche Anwendungen:

  • PCR
  • DNA-Sequenzierung
  • Sondierung
  • Mobilitätsverschiebung oder Hybridisierung

DNA Ausbeuten

 
Entsalzte DNA Oligos
Synthesis scale1 Length Restriction Guaranteed Yield2 Production Time [wd]
[OD260] [nmol]3
Genomics 13 - 60 2 10 1
0.04 µmol 13 - 80 3 15 1
0.2 µmol 6 - 1504 10 50 1
1.0 µmol 6 - 80 50 250 1
15 µmol 13 -60 700 3'500 2
 
 
 
1 Die Syntheseskala stellt die Ausgangsmenge an 3'-Basen (Ausgangsmaterial) dar.
2 Unsere garantierten und durchschnittlichen Ausbeuten sind in OD gemessen und gelten nur für unmodifizierte Oligos >20mer.
3 Die in nmol angegebenen Ausbeuten stellen eine Beispielrechnung für ein 20mer dar. Für diese Berechnung wurde die folgende Faustformel angewendet: nmol Oligo = OD x 100/Länge des Oligos. Bitte beachten Sie, dass diese Berechnung auf Sequenzen mit nahezu homogener Verteilung der 4 DNA-Basen basiert; sie kann bei Sequenzen mit hohem GC-Gehalt >70% etc. abweichen.
4 Oligos, die länger als 150 DNA-Basen sind, auf Anfrage (wir möchten das geplante Experiment/die Anwendung vorher mit Ihnen besprechen, um das bestmögliche Ergebnis zu gewährleisten)
5 Die in nmol angegebenen Ausbeuten stellen eine Beispielrechnung für ein 60mer dar. Faustformel: nmol Oligo = OD x 100/Länge des Oligos.

RNA Ausbeuten


Entsalzte RNA Oligos 
Synthesis scale1 Length Restriction Guaranteed Yield2 Production Time [wd]
[OD260] [nmol]3
Genomics not available
0.04 µmol 10 - 30 4 21 2
0.2 µmol 10 - 50 8 35 2
1.0 µmol 10 - 50 18 80 2
15 µmol 10 - 40 400 1'800 3
 

 

1 Der Synthesemaßstab entspricht der Ausgangsmenge an 3'-Basen (Ausgangsmaterial).
2 Unsere garantierten und durchschnittlichen Ausbeuten sind in OD gemessen und gelten nur für unmodifizierte Oligos >20 und <40 Nukleotide.
3 Die in nmol angegebenen Ausbeuten stellen eine Beispielrechnung für ein 20mer dar. Für diese Berechnung wurde die folgende Faustformel angewendet: nmol Oligo = OD x 100/Länge des Oligos. Bitte beachten Sie, dass diese Berechnung auf Sequenzen mit nahezu homogener Verteilung der 4 RNA-Basen basiert.